Mit dem Unteren Altmühltal ist das letzte Drittel des bayerischen Naturparks gemeint. Bekannte Orte sind hier Riedenburg, Dietfurt oder Kelheim, wo die Altmühl in die Donau mündet. Auch hier warten zahlreiche Naturphänomene wie der Blautopf oder das Schulerloch darauf, entdeckt zu werden.